Maria Cristina Cunha é Doutorada em História Medieval, na Faculdade de Letras da Universidade do Porto, com a Dissertação "A Chancelaria Arquiepiscopal de Braga 1071-1245". Professora Associada com Agregação da Faculdade de Letras da Universidade do Porto, Investigadora integrada da Unidade I&D CITCEM (Centro de Investigação Transdisciplinar “Cultura, Espaço, Memória”), colaboradora do CEHR (Centro de Estudos de História Religiosa, da Universidade Católica de Lisboa), membro da Comission International de Diplomatique, da Academia Portuguesa da História e Sócia da Sociedade Portuguesa de Estudos Medievais (SPEM).
Entre 2011 e 2017 foi Coordenadora Científica do CITCEM e responsável pelo Projecto Estratégico (financiado pelo Programa COMPETE) de 2013 a Maio de 2017.
Atualmente é investigadora do “Proyecto de Investigación de I+D Escritura, notariado y espacio urbano en la Corona de Castilla y Portugal (Siglos XII-XVII)”, sediado na Universidade de Sevilha e financiado pelo Ministerio de Educación y Ciência de Espanha.